昭和５１年 ２月：陸上自衛隊富士地区病院として開院
昭和６３年 ４月：自衛隊富士病院に名称変更
平成 ６年 ３月：新館増設（病棟・検査・外来診療室）
平成１２年 ４月：保健医療機関指定
平成２１年 ３月 ～ 平成２２年 ２月：旧館耐震工事
平成２２年 ６月 ～ 平成２３年１０月：移動式医療システム工事
（平成２３年１２月２２日に最初の訓練受入）
令和 ３年 ６月 ～ 令和 ５年 ４月：大規模病院改修工事
（スプリンクラー、非常用発電機等）